Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trip10Q8CJ53 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip10Q8CJ53 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms