Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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LgsnQ8CIX8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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LgsnQ8CIX8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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LgsnQ8CIX8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LgsnQ8CIX8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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