Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam20aQ8CID3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam20aQ8CID3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms