Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cog3Q8CI04 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms