Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Upp2Q8CGR7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms