Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rbm28Q8CGC6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbm28Q8CGC6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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