Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc3Q8CFZ4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpc3Q8CFZ4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms