Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cc2d2aQ8CFW7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cc2d2aQ8CFW7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cc2d2aQ8CFW7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 276.6 ms