Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms