Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc17Q8CE13 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc17Q8CE13 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc17Q8CE13 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc17Q8CE13 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc17Q8CE13 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc17Q8CE13 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc17Q8CE13 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc17Q8CE13 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc17Q8CE13 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc17Q8CE13 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc17Q8CE13 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc17Q8CE13 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc17Q8CE13 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc17Q8CE13 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc17Q8CE13 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc17Q8CE13 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc17Q8CE13 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc17Q8CE13 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc17Q8CE13 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc17Q8CE13 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc17Q8CE13 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms