Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc178Q8CDV0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc178Q8CDV0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms