Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atad2Q8CDM1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atad2Q8CDM1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms