Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Riox2Q8CD15 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Riox2Q8CD15 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms