Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms