Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps53Q8CCB4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps53Q8CCB4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.7 ms