Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrn3Q8CBC6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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