Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dclre1bQ8C7W7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dclre1bQ8C7W7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms