Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7D2

Crbn, Protein cereblon, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrbnQ8C7D2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CrbnQ8C7D2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CrbnQ8C7D2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CrbnQ8C7D2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CrbnQ8C7D2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CrbnQ8C7D2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CrbnQ8C7D2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CrbnQ8C7D2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CrbnQ8C7D2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CrbnQ8C7D2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CrbnQ8C7D2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CrbnQ8C7D2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CrbnQ8C7D2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms