Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp20Q8C6M1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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