Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6G0

Ifi27, Interferon, alpha-inducible protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi27Q8C6G0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms