Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
4930504O13RikQ8C5Z9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms