Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
4933409G03RikQ8C5U0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933409G03RikQ8C5U0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms