Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csgalnact2Q8C1F4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Csgalnact2Q8C1F4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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