Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ttc21aQ8C0S4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ttc21aQ8C0S4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc21aQ8C0S4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms