Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rapgef5Q8C0Q9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms