Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYH8

Chd9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 2,885 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd9Q8BYH8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
Chd9Q8BYH8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd9Q8BYH8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd9Q8BYH8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd9Q8BYH8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd9Q8BYH8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd9Q8BYH8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd9Q8BYH8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd9Q8BYH8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd9Q8BYH8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd9Q8BYH8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd9Q8BYH8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd9Q8BYH8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd9Q8BYH8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd9Q8BYH8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd9Q8BYH8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd9Q8BYH8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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