Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Iffo1Q8BXL9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Iffo1Q8BXL9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Iffo1Q8BXL9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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