Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn17Q8BXA6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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Cldn17Q8BXA6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn17Q8BXA6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms