Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slx1bQ8BX32 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slx1bQ8BX32 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slx1bQ8BX32 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slx1bQ8BX32 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slx1bQ8BX32 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slx1bQ8BX32 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slx1bQ8BX32 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Slx1bQ8BX32 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slx1bQ8BX32 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slx1bQ8BX32 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slx1bQ8BX32 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slx1bQ8BX32 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms