Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Triml1Q8BVP1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Triml1Q8BVP1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms