Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx17Q8BVL3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms