Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms