Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

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Length 924 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcaf1Q8BNE1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcaf1Q8BNE1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcaf1Q8BNE1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcaf1Q8BNE1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcaf1Q8BNE1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcaf1Q8BNE1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcaf1Q8BNE1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcaf1Q8BNE1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcaf1Q8BNE1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcaf1Q8BNE1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcaf1Q8BNE1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Tcaf1Q8BNE1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
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Tcaf1Q8BNE1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Tcaf1Q8BNE1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Tcaf1Q8BNE1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Tcaf1Q8BNE1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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Tcaf1Q8BNE1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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Tcaf1Q8BNE1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcaf1Q8BNE1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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Tcaf1Q8BNE1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcaf1Q8BNE1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Tcaf1Q8BNE1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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