Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLK3

Lsamp, Limbic system-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsampQ8BLK3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LsampQ8BLK3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms