Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hirip3Q8BLH7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms