Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp54Q8BL06 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms