Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zcchc4Q8BKW4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zcchc4Q8BKW4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zcchc4Q8BKW4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zcchc4Q8BKW4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zcchc4Q8BKW4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zcchc4Q8BKW4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zcchc4Q8BKW4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zcchc4Q8BKW4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zcchc4Q8BKW4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms