Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gpc2Q8BKV1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms