Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ56

Pnpla2, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla2Q8BJ56 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnpla2Q8BJ56 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnpla2Q8BJ56 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnpla2Q8BJ56 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnpla2Q8BJ56 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnpla2Q8BJ56 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnpla2Q8BJ56 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnpla2Q8BJ56 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnpla2Q8BJ56 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnpla2Q8BJ56 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnpla2Q8BJ56 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnpla2Q8BJ56 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pnpla2Q8BJ56 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pnpla2Q8BJ56 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pnpla2Q8BJ56 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pnpla2Q8BJ56 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pnpla2Q8BJ56 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla2Q8BJ56 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnpla2Q8BJ56 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms