Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbfox3Q8BIF2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms