Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf41Q8BH75 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf41Q8BH75 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf41Q8BH75 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms