Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Susd4Q8BH32 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Susd4Q8BH32 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Susd4Q8BH32 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Susd4Q8BH32 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Susd4Q8BH32 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Susd4Q8BH32 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Susd4Q8BH32 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Susd4Q8BH32 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Susd4Q8BH32 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Susd4Q8BH32 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Susd4Q8BH32 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Susd4Q8BH32 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Susd4Q8BH32 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Susd4Q8BH32 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Susd4Q8BH32 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Susd4Q8BH32 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms