Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms