Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp4f39Q8BGU0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms