Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ3

Uncharacterized protein C17orf100 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGJ3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Q8BGJ3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGJ3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms