Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Jmjd4Q8BFT6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms