Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srgap3Q812A2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srgap3Q812A2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms