Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4cQ811C2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4cQ811C2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms