Protein–RNA interactions for Protein: Q811B5

Prr3, Proline-rich protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr3Q811B5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr3Q811B5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms