Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b3Q80ZS5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34b3Q80ZS5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34b3Q80ZS5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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